西海岸校区建设指挥部成立于2017年3月，在学校西海岸校区规划和建设领导小组领导下，负责西海岸校区建设工作。下设综合部、前期部、技术部、工程部。其主要职责是：

1.认真贯彻执行国家有关基本建设的法律法规，按照“规范、优质、高效、安全、廉洁”的原则，建设西海岸校区。

2.负责西海岸校区校园规划的编制、报批和备案工作。

3.负责编制西海岸校区五年建设规划和年度建设计划。

4.负责组织实施年度项目建设。

5.负责工程建设的安全、质量、进度及投资管理。

6.负责编制西海岸校区建设的投资计划和年度用款计划，经学校批准后执行。

7.负责向学校党委、教代会汇报西海岸校区建设规划、质量、进度和财务预决算等工作。

8.负责与西海岸新区各有关单位的联系与协调工作。

9.在校长授权下，按照规定程序，代表学校签订各类合同或协议并加强监督和管理，维护学校利益。

10.负责西海岸校区基建档案和基建统计工作。

11.负责西海岸校区规章制度建设并执行监督。

12.负责指挥部工作人员的思想政治、廉政建设、考核评定等工作。

13.完成上级和学校交办的其他工作。